Con tres centros de producción, España se sitúa a la vanguardia tanto en inversión como en desarrollo de nuevos procesos. La calidad, la mejora continua y la seguridad son norma en todos los procesos productivos de Merck.
En la localidad barcelonesa de Mollet del Vallés se encuentran dos de sus centros de producción: farmacéutica y química y en el municipio madrileño de Tres Cantos se sitúa la planta biotecnológica.
Los tres centros de producción han sido inspeccionados y aprobados por las Autoridades Sanitarias Españolas (Ministerio de Sanidad y Política Social), Europeas (EMEA), Americanas (FDA), Canadienses (HPB), Brasileñas (ANVISA), Mejicanas y Japonesas.
Asimismo, Merck ha apostado por la certificación de calidad de sus instalaciones, que cuentan con el certificado ISO 9001 e ISO 14001. A su vez, lo procesos productivos se realizan de acuerdo a las normas GMP, que velan por la seguridad de los productos, empleados y medio ambiente.